Po zwycięstwie nad złym czarownikiem mistrzowie zaatakowani zostają przez Shao-Kahna, imperatora Zaświatów. Johnny Cage ginie. Rayden, bóg światła i gromu, wyjaśnia Liu i jego towarzyszom, że Shao-Kahn zdecydował się odrzucić reguły Mortal Kombat i zaprowadzić ,,piekło na ziemi, pomagając siłom Innego Świata przeniknąć do świata ludzi.